Hay por lo menos unas 400 especies de aves en la parte más elevada del bosque lluvioso, que incluyen al resplandeciente quetzal, antiguamente ave sagrada de los Mayas, más de 100 especies de mamíferos, 120 especies de anfibios y reptiles, y aproximadamente 2,500 especies de plantas, que hacen de Monteverde un verdadero paraíso para los amantes de las aves. La reserva tiene estaciones húmedas y secas, aunque las partes más altas tengan neblina y llueva mucho durante el año.